Antecedentes: A nivel mundial cada año casi un millón personas son afectados por la meningoencefalitis criptococósica; de estas 624 700 fallecen a pesar del empleo del tratamiento recomendado. En Cuba esta micosis se reportó por primera vez en la década de 1950 y su incidencia se incrementó dramáticamente tras la introducción del sida en este país.  Objetivos: Brindar una panorámica de los trabajos realizados en el Laboratorio de Micología del IPK con vistas a contribuir a un mejor conocimiento de la criptococosis y su agente causal mediante la caracterización de aislamientos cubanos del complejo de especies C. neoformans/gattii de origen clínico y ambiental. Metodología: Se estudiaron 202 aislamientos clínicos, 68 obtenidos a partir de excretas de palomas y 70 de detritos vegetales previamente identificados como C. neoformans/gattii. La identidad se confirmó mediante análisis de las tallas de fragmentos polimórficos obtenidos con enzimas de restricción (AFLP) y secuenciación de los fragmentos ITS1/ITS2-D1/D2. Se determinó el serotipo y tipo de apareamiento por la amplificación de los alelos a y α del locus STE20. Para la caracterización genética-epidemiológica se diseñó un juego de nueve cebadores para la detección de fragmentos cortos de repetición (STR). Se determinó la susceptibilidad frente a anfotericina B, flucitocina, fluconazol, itraconazol, voriconazol, posaconazol e isavuconazol, por el método de microdilución en medio líquido. Resultados: Se demostró que solo uno de los aislamientos recuperados de detritos vegetales correspondió con C. neoformans; todos los confirmados como pertenecientes a esta especie resultaron Aa; no obstante, el empleo del STR evidenció amplia diversidad genética, la cual resultó significativa al comparar los de procedencia ambiental con los de procedencia clínica. La caracterización de aislamientos seriados de pacientes con criptococosis recurrente evidenció que más del 70% de estos se encontraban infectados con genotipos diferentes. Las pruebas de susceptibilidad in vitro no detectaron resistencia a los antifúngicos probados, siendo el isavuconazol el más potente. Conclusiones: Se demostró la diversidad genética de C. neoformans/C. gattii en Cuba. Los resultados aportaron nuevas luces sobre la epidemiología y patogenia de la criptococosis, al sugerir la presencia de fuentes de infección adicionales hasta ahora no estudiadas y la infección con múltiples genotipos como mecanismo de recurrencia y/o persistencia. Se sugiere confirmar la identificación de este agente, especialmente cuando es recuperado de fuentes naturales.